一、管理服務機構

1、辦公室

2、組織部（統戰部）、機關黨委（合署）

3、宣傳部（新聞中心）

4、紀檢監察室

5、人事處（教師工作部）

6、教務處（評估建設辦公室、教學發展中心）

7、科技處（學科建設辦公室、學報編輯部）

8、學生處（學生工作部）

9、發展規劃處（高教研究室）

10、計劃財務處（資產管理辦公室）

11、審計處

12、實驗室與設備管理處（采購中心）

13、保衛處（人民武裝部）

14、社會合作處（校友辦公室、產學合作辦公室）

15、總務處（后勤服務中心）

16、校園建設處

17、國際交流與合作處（港澳臺辦公室）

二、群團組織

1、工  會（離退休工作辦公室）

2、團  委

三、教學、科研及教輔機構

1、水利與環境工程學院

2、建筑工程學院

3、測繪與市政工程學院

4、機械與汽車工程學院

5、電氣工程學院

6、經濟與管理學院

7、信息工程與藝術設計學院

8、國際教育交流學院

9、馬克思主義學院

10、基礎教學部 

11、體育與軍事教育部

12、繼續教育學院（浙江河（湖）長學院）

13、創業學院（工程實驗實訓中心）

14、圖書館

15、現代教育技術中心

16、基礎教輔黨總支

17、浙江水利與海洋工程研究所

18、浙江水文化研究所